1. Trang chủ
  2. Khác
  3. Câu hỏi thường gặp
  4. Câu hỏi thường gặp theo nghiệp vụ
  5. CHTG Thuế
  6. Hướng dẫn kê khai tờ khai quyết toán thuế TNDN năm (03/TNDN) với doanh nghiệp nhỏ và vừa miễn thuế TNDN 03 năm đầu

Hướng dẫn kê khai tờ khai quyết toán thuế TNDN năm (03/TNDN) với doanh nghiệp nhỏ và vừa miễn thuế TNDN 03 năm đầu

1. Tổng quan

Bài viết hướng dẫn lập tờ khai quyết toán thuế TNDN năm (03/TNDN) trên phần mềm MISA.

Nội dung bài viết bao gồm các bước khởi tạo tờ khai, thiết lập thông tin tờ khai và hướng dẫn điền các phụ lục liên quan.

Phạm vi đáp ứng: Áp dụng cho kế toán doanh nghiệp sử dụng phần mềm MISA để thực hiện quyết toán thuế TNDN năm.

2. Căn cứ pháp lý

  • Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 67/2025/QH15Nghị định số 320/2025/NĐ-CP quy định chi tiết thi hành.
  • Nghị định số 20/2026/NĐ-CP hướng dẫn thi hành Nghị quyết số 198/2025.
  • Các Thông tư hướng dẫn Luật Thuế TNDN, như: Thông tư 78/2014/TT-BTC, Thông tư 96/2015/TT-BTC.
  • Thông tư số 80/2021/TT-BTC của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Quản lý thuế.

Tài liệu, hồ sơ liên quan:

  • Báo cáo tài chính của năm quyết toán
  • Các tờ khai quyết toán thuế TNDN của các năm liền kề (05 năm gần nhất).
  • Biên bản kiểm tra, Quyết định xử phạt sau quyết toán thuế (nếu có).
  • Thông tin ngành nghề kinh doanh chính của doanh nghiệp (tra cứu theo Quyết định 27/2018/QĐ-TTg về Hệ thống ngành kinh tế Việt Nam).

3. Các bước thực hiện

Bước 1: Lập tờ khai quyết toán thuế TNDN năm (03/TNDN)

  • Vào phân hệ Thuế\Khai thuế, chọn Lập tờ khai \ Lập tờ khai quyết toán thuế TNDN năm (03/TNDN).

  • Chọn thông tin kê khai:
    • Chọn loại quyết toán: QT định kỳ
    • Chọn các phụ lục bắt buộc: 03-1A/TNDN, 03-3A/TNDN
    • Chọn phụ lục bổ trợ: 03-2/TNDN (nếu doanh nghiệp có số lỗ từ năm trước chuyển sang)

  • Nhấn Đồng ý. Xuất hiện giao diện tờ khai quyết toán thuế TNDN và kèm theo phụ lục đã lựa chọn

Bước 2: Thiết lập thông tin phụ lục đi kèm

Sau khi nhấn Đồng ý, xuất hiện giao diện tờ khai quyết toán thuế TNDN:

Thiết lập phụ lục ưu đãi 03-03A/TNDN

Đây là bước quan trọng để xác định điều kiện được miễn thuế. Phần dưới đây hướng dẫn cách điền một số chỉ tiêu liên quan trên phụ lục:

  • Mục (5): Chọn “Doanh nghiệp nhỏ và vừa trong 3 năm kể từ khi cấp giấy CNĐKDN lần đầu”

  • Mục (9), (10) Ưu đãi thuế suất: Doanh nghiệp miễn thuế TNDN 03 năm thuộc mục miễn giảm thuế nên không điền cột này. Thuế suất 15%, 17% không phải thuế suất ưu đãi mà là thuế suất trên ngưỡng doanh thu.

  • Mục (11) (12) : Số năm miễn giảm thuế ( Ví dụ: 3 năm )
    • Lưu ý: Thời gian miễn thuế TNDN 03 năm được tính liên tục từ năm đầu tiên được cấp Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp lần đầu.
    • Ví dụ: 
      • DN thành lập năm 2025 → được miễn thuế từ năm 2025 đến 2027.
      • DN thành lập năm 2024 → được miễn thuế từ năm 2025 đến 2026 (do năm 2024 chưa thuộc thời gian áp dụng chính sách).
      • DN thành lập năm 2023 → được miễn thuế năm 2025 (thời gian ưu đãi còn lại)
  • Mục (13) & (14): Kết quả hoạt động kinh doanh của hoạt động được hưởng ưu đãi
    • Nếu kết quả HĐKD của doanh nghiệp đều được hưởng ưu đãi thuế: Lấy số liệu từ Báo cáo kết quả hoạt động kinh doanh để điền số liệu
      • Doanh thu tính thuế: Doanh thu bán hàng và cung cấp dịch vụ + Doanh thu tài chính + Thu nhập khác
      • Chi phí tính thuế: Giá vốn + Chi phí quản lý doanh nghiệp + Chi phí khác – Chi phí không được trừ
    • Nếu chỉ được hưởng 1 phần ưu đãi: Nhập chính xác Doanh thu và Chi phí được trừ tương ứng
  • Mục số (15) Thu nhập miễn thuế: Là thu nhập nằm trong 14 khoản miễn thuế TNDN, với Doanh nghiệp miễn thuế TNDN 03 năm không thuộc 14 khoản miễn thuế TNDN thì ĐỂ TRỐNG chỉ tiêu này.
  • Mục (16) chỉ điền nếu có số lỗ chuyển kỳ.
  • Mục (18) & (22): Điền thuế suất ưu đãi và tỷ lệ miễn thuế (100%).

Thiết lập Phụ lục kết quả kinh doanh 03-1A/TNDN

Số liệu được chương trình tự động tổng hợp, đơn vị không cần điền tay. Anh/chị có thể kiểm tra số liệu theo cách lấy số liệu tại đây.

Phụ lục 03-2/TNDN Chuyển lỗ

Nếu có số lỗ phát sinh từ các kỳ trước:

    • Nhập số lỗ thực tế tại Mục (3) tương ứng với từng hoạt động.
    • Xác định số lỗ được chuyển vào kỳ này tại Mục (5).

Xem chi tiết hướng dẫn kê khai Tại đây

Bước 3: Hoàn tất Tờ khai quyết toán thuế TNDN năm (03/TNDN)

Khi lập Tờ khai quyết toán thuế TNDN mẫu 03/TNDN, một số chỉ tiêu trên tờ khai sẽ được tự động tổng hợp từ các phụ lục kèm theo. Một số chỉ tiêu cần lưu ý:

  • Chỉ tiêu [04] & [05]: Chọn ngành nghề và tỷ lệ tương ứng.
  • Chỉ tiêu B4: Lấy số liệu của các khoản chi phí hạch toán ở các TK: 632, 635, 641, 642, 811 và tích chọn là chi phí không hợp lý trên chứng từ. Có thể kiểm tra lại các chứng từ đang chọn Chi phí không hợp lý Tại đây
  • Chỉ tiêu C7: ở dòng STT 6.1 – mã chỉ tiêu C7, nhấn biểu tượng mũi tên để chọn loại Thu nhập tính thuế áp dụng mức thuế suất 15% / 17% / 20% tương đương chỉ tiêu C6.

Lưu ý: Doanh nghiệp cần lưu giữ đầy đủ Giấy chứng nhận ĐKDN lần đầu và chứng từ kế toán liên quan để giải trình điều kiện miễn thuế 3 năm khi có yêu cầu thanh tra, kiểm tra.

Cập nhật 10/03/2026


Bài viết này hữu ích chứ?

Nền tảng quản trị doanh nghiệp hợp nhất MISA AMIS với gần 200.000 khách hàng doanh nghiệp đang sử dụng

Bài viết liên quan

Giải đáp miễn phí qua Facebook
Nếu bạn vẫn còn thắc mắc hãy đăng câu hỏi vào Cộng đồng MISA qua facebook để được giải đáp miễn phí và nhanh chóng
Đăng bài ngay